MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 1539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CTTGAG	2	12	240	251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387504722
2	NC_017653	TCA	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504722
3	NC_017653	CG	3	6	313	318	0 %	0 %	50 %	50 %	387504722
4	NC_017653	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504722
5	NC_017653	A	6	6	325	330	100 %	0 %	0 %	0 %	387504722
6	NC_017653	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	387504722
7	NC_017653	TGA	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504723
8	NC_017653	GGC	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504723
9	NC_017653	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504723
10	NC_017653	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
11	NC_017653	TCG	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504723
12	NC_017653	GAAAA	2	10	797	806	80 %	0 %	20 %	0 %	387504723
13	NC_017653	GTTC	2	8	868	875	0 %	50 %	25 %	25 %	387504723
14	NC_017653	TGA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504723
15	NC_017653	ACT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504723
16	NC_017653	A	6	6	1164	1169	100 %	0 %	0 %	0 %	387504723
17	NC_017653	CCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504723
18	NC_017653	GATT	2	8	1244	1251	25 %	50 %	25 %	0 %	387504723
19	NC_017653	CCTGG	2	10	1284	1293	0 %	20 %	40 %	40 %	387504723
20	NC_017653	CG	3	6	1320	1325	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
21	NC_017653	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504723
22	NC_017653	CTG	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504723
23	NC_017653	CTGT	2	8	1557	1564	0 %	50 %	25 %	25 %	387504724
24	NC_017653	GTG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504724
25	NC_017653	TGA	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
26	NC_017653	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504724
27	NC_017653	AGT	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
28	NC_017653	ATG	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
29	NC_017653	A	7	7	1828	1834	100 %	0 %	0 %	0 %	387504724
30	NC_017653	GGA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504725
31	NC_017653	TAT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504725
32	NC_017653	TA	3	6	2978	2983	50 %	50 %	0 %	0 %	387504725
33	NC_017653	AGATA	2	10	3082	3091	60 %	20 %	20 %	0 %	387504725
34	NC_017653	GACT	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	387504726
35	NC_017653	TGG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
36	NC_017653	CAG	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
37	NC_017653	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
38	NC_017653	GTG	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
39	NC_017653	TTC	2	6	3597	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504726
40	NC_017653	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
41	NC_017653	AGG	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504726
42	NC_017653	CGG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504726
43	NC_017653	ACA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504726
44	NC_017653	TGC	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504726
45	NC_017653	CCG	2	6	3909	3914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
46	NC_017653	GCC	2	6	3956	3961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
47	NC_017653	CAG	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
48	NC_017653	CAC	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504726
49	NC_017653	AAT	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504726
50	NC_017653	CAG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
51	NC_017653	CGG	2	6	4208	4213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504726
52	NC_017653	CCTTC	2	10	4224	4233	0 %	40 %	0 %	60 %	387504726
53	NC_017653	TGG	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
54	NC_017653	CAG	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
55	NC_017653	CAG	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
56	NC_017653	CAG	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
57	NC_017653	TACGA	2	10	4483	4492	40 %	20 %	20 %	20 %	387504727
58	NC_017653	AAT	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
59	NC_017653	ATA	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
60	NC_017653	ACG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
61	NC_017653	T	6	6	4647	4652	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
62	NC_017653	CGGA	2	8	4653	4660	25 %	0 %	50 %	25 %	387504727
63	NC_017653	ACC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504727
64	NC_017653	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504727
65	NC_017653	TAA	2	6	4752	4757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
66	NC_017653	CAGA	2	8	4785	4792	50 %	0 %	25 %	25 %	387504727
67	NC_017653	TCA	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504727
68	NC_017653	GT	4	8	4909	4916	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
69	NC_017653	AAT	2	6	4924	4929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
70	NC_017653	CATCCA	2	12	4932	4943	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387504727
71	NC_017653	CTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504727
72	NC_017653	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
73	NC_017653	T	6	6	5059	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
74	NC_017653	TG	3	6	5084	5089	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
75	NC_017653	GAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504727
76	NC_017653	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	387504728
77	NC_017653	ACG	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504728
78	NC_017653	CAC	2	6	5556	5561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504728
79	NC_017653	GCA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504728
80	NC_017653	CTGG	2	8	5600	5607	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
81	NC_017653	AAGA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	387504728
82	NC_017653	GCTG	2	8	5681	5688	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
83	NC_017653	CAT	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504728
84	NC_017653	TAA	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504728
85	NC_017653	CTG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504729
86	NC_017653	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504729
87	NC_017653	CGC	3	9	6021	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504729
88	NC_017653	GCT	2	6	6044	6049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504729
89	NC_017653	TGG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504729
90	NC_017653	TTA	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504729
91	NC_017653	TCC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504729
92	NC_017653	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	387504729
93	NC_017653	ACA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504729
94	NC_017653	AGGAAA	2	12	6530	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504729
95	NC_017653	ATG	2	6	7984	7989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504730
96	NC_017653	TTC	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504730
97	NC_017653	TGTT	2	8	8039	8046	0 %	75 %	25 %	0 %	387504730
98	NC_017653	CGA	2	6	8054	8059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504730
99	NC_017653	GTA	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504730
100	NC_017653	TC	3	6	8206	8211	0 %	50 %	0 %	50 %	387504731
101	NC_017653	GTC	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504731
102	NC_017653	CTT	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504731
103	NC_017653	GAC	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504731
104	NC_017653	TAA	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504731
105	NC_017653	T	6	6	8453	8458	0 %	100 %	0 %	0 %	387504731
106	NC_017653	GAA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504731
107	NC_017653	TCT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504731
108	NC_017653	AAC	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504731
109	NC_017653	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504732
110	NC_017653	CCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
111	NC_017653	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504732
112	NC_017653	CAGC	2	8	8774	8781	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
113	NC_017653	GCG	2	6	8871	8876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
114	NC_017653	CAT	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
115	NC_017653	CGG	2	6	8905	8910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
116	NC_017653	TGG	2	6	8950	8955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
117	NC_017653	TGA	2	6	8969	8974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
118	NC_017653	CTT	2	6	8980	8985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504732
119	NC_017653	GGC	2	6	8999	9004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
120	NC_017653	TCC	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504732
121	NC_017653	CCA	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
122	NC_017653	CGT	2	6	9295	9300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
123	NC_017653	TGG	2	6	9337	9342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
124	NC_017653	GCG	2	6	9381	9386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
125	NC_017653	CTG	2	6	9415	9420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
126	NC_017653	GC	4	8	9425	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
127	NC_017653	TGC	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
128	NC_017653	CTGTG	2	10	9494	9503	0 %	40 %	40 %	20 %	387504732
129	NC_017653	T	6	6	9601	9606	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
130	NC_017653	CAT	2	6	9761	9766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
131	NC_017653	GAC	2	6	9789	9794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504732
132	NC_017653	GC	3	6	9799	9804	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
133	NC_017653	CAA	2	6	9856	9861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504732
134	NC_017653	GCT	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
135	NC_017653	ATG	2	6	9960	9965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
136	NC_017653	CCA	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
137	NC_017653	GAT	2	6	10097	10102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
138	NC_017653	GC	3	6	10113	10118	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
139	NC_017653	GTA	2	6	10169	10174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
140	NC_017653	ACTC	2	8	10213	10220	25 %	25 %	0 %	50 %	387504732
141	NC_017653	TTTA	2	8	10259	10266	25 %	75 %	0 %	0 %	387504732
142	NC_017653	TCC	2	6	10272	10277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504732
143	NC_017653	AAT	2	6	10329	10334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504732
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145	NC_017653	ACG	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504732
146	NC_017653	CG	3	6	10397	10402	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
147	NC_017653	AAC	2	6	10413	10418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504732
148	NC_017653	TG	3	6	10427	10432	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
149	NC_017653	GCT	2	6	10473	10478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
150	NC_017653	CGG	2	6	10513	10518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
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152	NC_017653	TAG	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
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154	NC_017653	CAT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
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156	NC_017653	GGA	2	6	10780	10785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504732
157	NC_017653	AGT	3	9	10855	10863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
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159	NC_017653	CTGG	2	8	10926	10933	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
160	NC_017653	GAT	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
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164	NC_017653	CCCA	2	8	11063	11070	25 %	0 %	0 %	75 %	387504732
165	NC_017653	CATTT	2	10	11075	11084	20 %	60 %	0 %	20 %	387504732
166	NC_017653	TGC	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
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168	NC_017653	T	6	6	11305	11310	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
169	NC_017653	GAT	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
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172	NC_017653	ATC	2	6	11528	11533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
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176	NC_017653	ATT	2	6	11676	11681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504732
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259	NC_017653	CT	3	6	15857	15862	0 %	50 %	0 %	50 %	387504733
260	NC_017653	AAG	2	6	15869	15874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504733
261	NC_017653	CGC	2	6	15931	15936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504733
262	NC_017653	TG	3	6	15945	15950	0 %	50 %	50 %	0 %	387504733
263	NC_017653	TGA	2	6	15957	15962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504733
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270	NC_017653	ATC	2	6	16433	16438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504733
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498	NC_017653	CCA	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504749
499	NC_017653	GAT	2	6	29976	29981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504749
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